この例は，高解像度透過型電子顕微鏡画像(TEM)上で原子平面間の距離を測定するためにどのようにFFTをしようするかということを提示します。ImageJ1.33かそれ以降が必要です。
原子平面は左上部の角にあります。画像の目盛りは左下部の角にバーとして提供(ナノメーターで)されています。元の1020x1020 TIFF画像はまた，提供されています(クリックすると，TEM画像のダウンロードが始まります。)。
画像の空間キャリブレーションをするために，スケールバー上で拡大します。それを直線選択枠で選択し，Analyze/Set Scaleを選択します。
セットスケールダイアログボックスの中で"Known Distance"を5にセットします。"Unit of Length"に"nm"とセットし，"OK"をクリックします。スケールバーの長さは自動的に"Distance in Pixels"フィールドに入力されることに注意してください。
原子平面の距離を測定するためには，まずFFTを計算するためにProcess/FFTを使用し，平面を表しているFFT内の点まで，カーソルを動かします。そして，平面の距離(0.19nm/cycle)は，ImageJのステータスバーに表示されます。
原子平面の距離を測定する別の方法は，プロットプロファイルを作成し，手動で，周期を数えます。その時，距離(この場合3.61)を周期の数(19)で割ります。
TEM画像は Federal University of Minas Gerais, Belo Horizonte, BrasilのRodrigo Andradeの貢献です。
09/12/03 加筆修正